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创新中心由是巴彦淖尔市农牧业科学研究所举办的二级独立法人机构，中心主要职责为围绕肉羊产业战略、种质资源创新、产业安全、科技合作、成果评价、市场孵化等方面开展工作，构建协同创新的运行机制，推动肉羊产业绿色高质量发展。为肉羊技术提供资源支持，促进肉羊产业创新成果产出，引导肉羊产业创新发展。肉羊种质资源创新。开展种源技术联合攻关，培育区域性稳定多羔肉羊新品种。肉羊健康养殖研究。开展适度规模饲养条件下节本增效养殖综合技术应用示范、优质高繁舍饲肉羊营养需要量制定与当地饲草料匹配性研究与应用开发、肉羊智能化、轻简化适用设备研发。特色羊肉加工研究。开展羊肉即食产品、方便产品、风味产品、家庭产品、半成品、地方特色产品等的研究开发。肉羊高值化利用研发。开展肉羊副产物高值化利用研究，重点建立副产物中功效成分规模化提取方法及功效评价手段。羊肉品质评价与检测。建立羊肉产品质量溯源体系，开展羊肉品质风险评估等，为创建绿色优质巴彦淖尔羊肉品牌提供技术支持。肉羊疫病预防与控制研究。开展全域肉羊养殖过程中规范化疫病防控程序标准的制定，研制肉羊疫病快速检测试剂盒。
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